抗生素使用会对肠道菌群造成影响，导致菌群失调。一般情况下，抗生素会破坏肠道菌群的平衡，促使一些有害菌的繁殖，从而引发一系列问题，例如腹泻、便秘等消化系统问题。在使用抗生素期间，可以适当地进行膳食调节，增加膳食纤维和益生菌，有助于维护肠道健康。
只有合并幽门螺杆菌感染的慢性胃炎需要使用抗生素，临床首选的抗生素组合为阿莫西林联合克拉霉素。只有检测明确幽门螺杆菌阳性的活动性慢性胃炎，才需要联合使用抗生素根除病菌，从病因上控制炎症进展。
