净额法确认收入同时全额开具发票是符合规定的，属于正常的税会差异处理，完全允许这么操作。
1，会计准则和增值税征管的判定口径本身就不一样。会计上按净额还是总额确认收入，核心是判断企业在交易中是主要责任人还是代理人，代理人只就赚取的佣金服务费净额确认收入；而开票是根据增值税纳税义务来的，只要业务真实，全额收取交易款项的情况下，按全额开票不违反税务规定，两者并不冲突。
2，实务中有大量成熟的常见场景就是这么操作的。比如劳务派遣公司，向用工单位收取包含派遣员工工资、社保在内的总款项，会计上只把赚取的服务费按净额确认收入，开票时可以选择全额开具增值税发票，之后按差额计算缴纳增值税即可；还有做代销业务的第三方平台、经纪代理服务机构，很多都是按净额确认收入、全额开给终端客户发票，属于行业内通用的合规操作。
3，操作中只要做好细节合规就不会有风险。一方面要准确核算税会差异，会计账簿按会计准则要求净额记收入，增值税申报的时候按规定填列差额扣除项、按正确税基计税即可，不需要强制要求会计收入和开票金额完全一致；另一方面要留存好交易相关的合同、三方约定等证明材料，证明自身的代理人身份和业务真实性质，足以应对后续核查。
