肠道中的有害菌包括：
1. 大肠杆菌（Escherichia coli）
2. 沙门氏菌（Salmonella）
3. 肠炎弧菌（Vibrio cholerae）
4. 耐药性菌株（如MRSA、VRE等）
5. 产气荚膜梭菌（Clostridium difficile）
6. 弯曲菌（Campylobacter）
7. 嗜酸乳杆菌（Lactobacillus acidophilus）等。
肠道菌群失调的核心机制是各种内外部因素打破了肠道菌群与宿主之间长期维持的共生平衡，导致菌群的种类组成、数量分布、功能结构出现异常偏移，进而引发一系列病理改变。
